在好氧性条件下，由于好氧性菌的作用，将去除畜粪中的有机物在分解过程中产生的有害物质，同时蒸发畜粪中的水分，使之变成易于处理的优质有机肥。
重要的是改善畜粪中的通气性，使通气均匀，这样好氧性菌会迅速增殖，反复进行发酵活动。
再则，需要空气的理由是因为伴随发酵所产生的热量蒸发水分，使之成为低水分的易于处理的堆肥。
同时由于发酵过程中产生的发酵热，能杀死病原菌及杂草种子等。
